すみません．私自身は C++ コードを Wasm にコンパイルすることはほぼないので setjmp/longjmp を使っているコードでコンパイルの時点で失敗するものがあるのかどうかについてはちょっとすぐにはわかりません．(C++ コードを見たら Rust や Swift で書き直せばええやん病にかかっているため)