アプリだとわかんないですが、サーバサイドでは不要な依存が1つでも多く持ち込まれているためにテストを書く手間が増えたりするので、
はかなり避けたい寄りですね
Storeが利用しないprotocolの群も含める
テストのときに利用しない依存まで埋めないといけないという話ですよね？型単位でインジェクトしてもインジェクトされた側が使わないメソッドとかもあるので、テストモジュールではDI用のプロトコルに何もしない（
fatalError になる）デフォルト実装を書くようにしており、そうするとダミーの依存の埋めるのがそんなに大変じゃない印象ですね。