Carthageで〜.xcarchiveが１つ上のディレクトリにできてしまう問題を調べててわかったんだけど、xcodebuild archiveの-archivePathオプションは必ず引数をファイルだと解釈するためで、もともとCarthageでは-archivePath ./となってて、それだと例えばカレントディレクトリが/Users/katsumi/Desktop/SomeProject/の場合、-archivePathオプションの引数は-archivePath /Users/katsumi/Desktop/SomeProjectとなってxcodebuildは/Users/katsumi/Desktop/SomeProject.xcarchiveというファイルを作る、という仕様。