XIBから参照されるバンドルは、そのXIB自体が入っているバンドルなので

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storyboardファイルをその画像が入っているバンドルに入れたら、

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読み込めたと思います。

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リソースをすべて集めたバンドルを作り

このバンドルにstoryboardもリソースとして入れてしまうとか。

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画面（機能）グループでバンドルを分けたくて、でも共通素材は別のバンドルにまとめたいなら、コードしかない気がします。