https://www.python.org/downloads/release/python-365/ ここにある macOS 64-bit installer で Python 3をインストールしたら、Python.frameworkは /Library/Frameworks にインストールされました。/System/Library/Frameworks 以下はそのままのようですね。

$ ls /Library/Frameworks/Python.framework/Versions 3.6 $ ls /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions 2.3 2.5 2.6 2.7 Current

Python Release Python 3.6.5

The official home of the Python Programming Language