うまく説明できるか自信はありませんが。証明書は昔はiOSとmacOS毎でしたが、両方で動くようになったのでAppleというのが出てきました。証明書はアプリを署名するためのもので、開発用は開発者毎、配布用は配布元を示すものなので、使いまわすべきもの。例えば、村上がアプリAとアプリBをストアからリリースした場合、リリース元は村上ですので、村上の証明書で署名されるべきで、村上aや村上bが存在したら困っちゃう。という感じでしょうか。