上の説明、正しくないですね。正確にはCommand Line Toolはバンドルを持てないのでSwiftの「標準ライブラリ」をバンドルに含むことができなくて、SwiftyAlgebraが標準ライブラリを参照しようとして見つからないのが最初のエラー。rpathをXcodeの/usr/libに向けてSwiftyAlgebraが標準ライブラリを見つけられるようにしたのが佐野さんの対処で、それだと動くけどCommand Line Toolに静的リンクされている標準ライブラリと衝突するのでそのエラーのログが出てしまうという状態（移植性も失われる）。