SwiftDataはCore Dataのラッパーだから基本的にCore Dataがとても難しいのでできるだけSwiftDataを直接使う部分を小さくしてさっさと普通のオブジェクトに変換してしまうのが私はベターだと思います。

②にするとSwiftDataのよさを殺し

というのは合ってると思いますが、SwiftUIとSwiftDataが簡単にできるのは簡単なケースだけなのですぐにそれに当てはまらなくなって大変になるので私はそこは気にしないほうがいいと思います。