macOS の swiftly でインストールしたツールチェーンは標準のツールチェーンのパスにインストールされるので，今まで通り VS Code の Swift extension の機能にあるツールチェーン選択で一覧から選択するだけですよ． Linux の場合は以前から swiftly 対応してますし． GSoC 2025 のプロジェクトアイデアではさらに VS Code と swiftly のインテグレーションを進めて，ツールチェーンのインストールとかも VS Code 上からできるようにするアイデアとか書かれてましたね．